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| 產(chǎn)地 | 美國(guó) |
| 品牌 | 安捷倫 |
| 貨號(hào) | 5191-4080 |
| 用途 | 酶切片段化 |
| 包裝規(guī)格 | 96 reactions |
| CAS編號(hào) | |
| 純度 | % |
| 是否進(jìn)口 |
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安捷倫 SureSelect酶切片段化試劑盒
產(chǎn)品名稱：SureSelect enzymatic fragmentation kit, 96 reactions
產(chǎn)品貨號(hào)：5191-4080
適用于DNA起始量在10ng-200ng之間的各種GC含量、不同樣本類型（血液、新鮮冷凍組織和FFPE），推薦在37攝氏度酶解15分鐘。
酶裂解的熱循環(huán)程序
步驟 | 溫度 | 時(shí)間 |
1 | 37℃ | 見(jiàn)下表 |
2 | 65℃ | 5min |
3 | 4℃ | Hold |
碎片持續(xù)時(shí)間基于樣本類型和NGS讀取長(zhǎng)度
NGS read 長(zhǎng)度 | 目標(biāo)片段的大小 | 持續(xù)時(shí)間為37℃ | |
高質(zhì)量的DNA樣本 | FFPE DNA樣本 | ||
2X100 | 150-200bp | 15min | 15min |
2X150 | 180-250bp | 10 min | 15min |
1.準(zhǔn)備基因組DNA樣本并分析其質(zhì)量
文庫(kù)制備方案要求輸入10 ng到200 ng的gDNA，初始DNA樣品體積為7 ul，用于酶促DNA損傷對(duì)于某些FFPE樣品，DNA輸入量或定量方法可能需要調(diào)整。如下詳細(xì)。為了獲得*的測(cè)序結(jié)果，在推薦范圍內(nèi)使用*數(shù)量的DNA輸入
2.從新鮮生物樣品中制備高質(zhì)量的Gdna
采用合適的純化系統(tǒng)，如Qiagen's QIAamp DNA迷你試劑盒，按照制造商的協(xié)議進(jìn)行純化準(zhǔn)備請(qǐng)注意確保基因組DNA樣本質(zhì)量高，OD為260/280范圍從1.8到2.0.使用Oubit BR dsDNA檢測(cè)試劑盒測(cè)定每個(gè)gDNA樣品的濃度。按照制造商對(duì)儀器和檢測(cè)試劑盒的說(shuō)明操作從新鮮生物樣本中提取的DNA不需要額外的DNA樣本鑒定。
3.從FFPE樣品中制備和鑒定gDNA
使用Qiagen's QIAamp DNA FFPE組織試劑盒和Qiagen’s QIAamp DNA FFPE Tissue Kit，按照制造商的協(xié)議從FFPE組織切片中制備gDNA。分兩輪洗脫MinElute柱上的fina gDNA樣品，每輪使用30 ul緩沖液ATE。最終洗脫體積約為60 ul。
請(qǐng)注意如果組織在蛋白酶K消化一小時(shí)后出現(xiàn)不完全裂解。加入另外10 ul的蛋白酶K，在56℃繼續(xù)孵育。周期性的混合，持續(xù)3個(gè)小時(shí)。
將gDNA樣本保存在冰中，以便當(dāng)天文庫(kù)準(zhǔn)備，或在-20℃保存以備日后處理。
更多熱賣產(chǎn)品：
| 貨號(hào) | 品名 |
| 200600 | DNA Extraction Kit |
| G2991AA | 4200 TapeStation 系統(tǒng) |
| G9700A | Agilent NGS FFPE QC, 16 samples |
| G9700B | Agilent NGS FFPE QC, 96 samples |
| 5191-4079 | SureSelect enzymatic fragmentation kit, 16 reactions |
| 5191-4080 | SureSelect enzymatic fragmentation kit, 96 reactions |
| G9682A | SureSelectQXT Library Prep Kit, ILM, 16 |
| G9682B | SureSelectQXT Library Prep Kit, ILM, 96 |
| G9611B | SureSelectXT Reagent kit, HSQ, 96 |
| G9611A | SureSelectXT Reagent kit, HSQ, 16 |
| G9703A | SSEL XT Low Input Reagent Kit (1-96) |
| G9703B | SSEL XT Low Input Reagent Kit (97-192) |
| G9702A | SSEL XT HS Reagent Kit (1-16), 16rxn |
| G9702C | SSEL XT HS Reagent Kit (1-32), 96rxn |
| G9981A | SureSelect XT HS2 DNA reagent kit with index primer pairs 1–16, 16 reactions |
| G9983A | SureSelect XT HS2 DNA reagent kit with index primer pairs 1–96, 96 reactions |
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