眾所周知，真核生物細胞含有一些高豐度RNA，其中含量最高的是核糖體RNA（rRNA），而血液的RNA中含量第二高的就是珠蛋白（globin）RNA。這兩種RNA占血液樣本總RNA的85%以上。

如果不進行處理就建庫測序，高豐度RNA占據(jù)著大量的數(shù)據(jù)，不僅浪費了測序成本，更淹沒了目標RNA的數(shù)據(jù)，特別是一些低豐度但起著關鍵調控的RNA或者是罕見融合位點，使我們難以比較表達的差異化和特異性。

利用mRNA的polyA尾特點來富集mRNA的方法，雖然可以去除核糖體RNA，但并不能去除globin mRNA，同時其它的非編碼RNA的品種也會一并丟失。另外，在RNA樣本的質量不高時，由于降解導致polyA尾的不完整，這種方法也不適用。

RNA酶H法的原理：rRNA及globin RNA與特異互補的DNA寡核苷酸鏈雜交，接著與DNA鏈雜交的RNA品種被RNA酶H特異消化去除，引入的DNA鏈則通過后續(xù)的DNA酶消化而去除。